1927 г. стал переломным в судьбе Мабуни Кэнва. В октябре этого года Окинаву по приглашению Окинавского отделения Всеяпонской ассоциации физической культуры и Общества обладателей черных поясов по дзюдо префектуры Окинава в сопровождении ряда ведущих мастеров Кодокана посетил основатель дзюдо Кано Дзигоро. Направляясь на остров, Кано через Министерство просвещения направил в адрес губернатора префектуры просьбу об организации для него показа различных направлений каратэ. В это время Кано был самым уважаемым человеком в мире будо и занимал целый ряд важных постов: являлся представителем Японии в Международном олимпийском комитете, почетным президентом Японской ассоциации физической культуры, членом верхней палаты японского парламента. Поэтому и чиновники префектуры, и каратисты не могли оставить неудовлетворенной его просьбу. Во время показательных выступлений крупнейшие окинавские специалисты -Ябу Кэнцу, Ханасиро Тёмо, Куба Косаку, Кян Тётоку, Мияги Тёдзюн, Мабуни Кэнва - продемонстрировали Кано Дзигоро различные ката, а Мияги Тёдзюн и Мабуни Кэнва подробно комментировали происходящее.

Показательные выступления произвели большое впечатление на мэтра будо. Он дал высокую оценку каратэ как виду боевого искусства и высказал мнение о необходимости его широкого распространения в масштабе всей Японии. Это и явилось главным толчком, побудившим Мабуни Кэнва принять решение о том, чтобы переехать в Японию и посвятить себя распространению каратэ.

В мае 1928 г. Мабуни уволился со службы в полиции и отбыл в Токио. Первым делом, он нанес визит вежливости Кано Дзигоро, который обещал ему свою поддержку. Каратист снял квартиру неподалеку от усадьбы Кониси Ясухиро, инструктора кэндо в университете Кэйо, мастера дзюдзюцу и дзёд-зюцу и ученика Фунакоси Гитина по каратэ. В дальнейшем Кониси оказал ему большую помощь. Это был человек весьма состоятельный и чрезвычайно увлеченный каратэ. Почти год Мабуни прожил в его доме.

В течение нескольких месяцев Мабуни Кэнва провел демонстрации ката каратэ в Главном полицейском управлении, Кодока-не, Министерстве путей сообщения, университете Тоё, однако набрать достаточного количества учеников ему не удалось. В Токио уже в течение 6 лет на ниве каратэ трудился Фунакоси, и большинство желающих - а их было не так уж много - уже занимались у него. Поэтому в 1929 г. мастер перебрался в Осаку, которая и стала его основной базой.

После переезда Мабуни открыл небольшое додзё на улице Цурумибаси-дори в районе Нисинари и развернул широкую кампанию по пропаганде каратэ, проводил показательные выступления повсюду: в полицейских участках, высших учебных заведениях и даже в буддийских храмах. В результате титанических усилий мастера в 1931 г. образовалась Ассоциация каратэдо Великой Японии (Дай Нихон каратэдо кай), которая впоследствии была переименована в Японскую ассоциацию каратэдо (Нихон каратэдо кай). В 1933 г. он стал инструктором каратэ в осакском Университете Кансай, а в 1934 г. основал додзё Ёсюкан - Дворец взращивания талантов.

Для популяризации каратэ он одну за другой издает 4 книги: "Каратэдзюцу" (Осака, 1933), "Кобо дзидзай каратэ кэмпо дзюхати-но кэнкю" (Восемнадцать исследований по каратэ, разновидности кэмпо, высокоэффективной в нападении и защите, Осака, 1934), "Кобо дзидзай госин кэмпо каратэдо нюмон" (Вводный курс каратэдо, эффективной в нападении и защите разновидности самообороны кэмпо, Осака, 1935), "Кобо кэмпо каратэдо нюмон" (Вводный курс каратэдо, искусства нападения и защиты, Осака, 1938; совместно с Накасонэ Гэнва).

В 1930-е гг. в период самостоятельной тренерской деятельности Мабуни постепенно пришел к созданию собственной школы каратэдо. В то время общее руководство развитием будо в Японии осуществляла Ассоциация воинской добродетели Великой Японии - Дай Ниппон Бутокукай. Все школы всех направлений будо подлежали регистрации ею. Для регистрации школы требовалось указать ее название и предоставить программу. Мабуни назвал свою школу "Си-то-рю" - "Школа Итосу и Хигаонна" ("си" -другое прочтение иероглифа "ито" из фамилии "Итосу", а "то" - другое прочтение иероглифа "хига" из фамилии Хигаонна) - и в марте 1939 г. зарегистрировал ее в штаб-квартире Дай Ниппон Бутокукай.

В 1939 г. Ассоциацией воинской добродетели он был удостоен звания младшего наставника (рэнси), а в 1942 г. - второго из трех званий наставников тасси (эквивалент более раннему званию кёси).

Мабуни считал самым главным в каратэ-до ката. "Самое важное в каратэ - ката. В них собраны все приемы нападения и защиты. Поэтому нужно хорошо понимать смысл ката и выполнять их правильно", - писал он. И в его школе было собрано самое большое число ката стилей Сюритэ, Нахатэ и То-маритэ. Полагают, что он первым ввел в обиход "бункай кумитэ" - спаринговую расшифровку техники ката, определил назначение и установил правильное применение каждого комплекса для того, чтобы помочь ученикам овладеть применением приемов в свободном спарринге и обеспечить полноценную передачу знаний, зашифрованных в ката, последующим поколениям. Большое внимание Мабуни уделял спаррингу, как по правилам сундомэ с фиксацией удара в нескольких сантиметрах от мишени, так и в защитном снаряжении (богу) с полным контактом. Надо заметить, что Мабуни одним из первых ввел в своем додзё Ёсюкан контактные поединки в доспехах для кэндо и боксерских перчатках.